Mentre le biotecnologie e le aziende farmaceutiche producono entrambi medicinali, i farmaci delle società di biotecnologia hanno una base biologica e le medicine farmaceutiche hanno una base chimica. Le aziende di biotecnologie utilizzano organismi vivi oi loro prodotti, come i batteri o gli enzimi, per produrre i loro farmaci. Al contrario, le aziende farmaceutiche utilizzano solo materiali chimici - e generalmente artificiali - per creare farmaci.
La biotecnologia ha anche più applicazioni rispetto alle aziende farmaceutiche. Ad esempio, le società di biotecnologie hanno sviluppato versioni di colture senza allergeni alimentari specifici, colture che richiedono meno pesticidi e colture con un profilo nutriente più completo. Sebbene ci sia qualche sovrapposizione tra biotecnologie e aziende farmaceutiche in termini di ricerca, produzione e distribuzione di droghe, la portata della biotecnologia è molto maggiore.
C'è anche una considerevole differenza nei costi operativi, in particolare nei costi di ricerca e sviluppo. Le aziende di biotecnologie hanno costi molto più elevati a causa della loro attenzione alla ricerca e allo sviluppo (in contrapposizione alla produzione con aziende farmaceutiche) e alla durata e alla difficoltà di sperimentazione e creazione di nuovi prodotti.
La discrepanza nel costo e nella durata necessaria per la fabbricazione di un nuovo prodotto ha portato a prodotti biotecnologici che detengono i loro brevetti per molto più a lungo delle aziende farmaceutiche. Laddove le aziende farmaceutiche dispongono generalmente dei diritti esclusivi per la fabbricazione e la distribuzione dei loro farmaci per cinque anni, le società di biotecnologie hanno i loro brevetti per dodici anni.
Tutto ciò porta a profitti molto volatili per le aziende di biotecnologie. Molti operano in perdita per molti anni fino a produrre una sostanza altamente redditizia, quando i loro profitti possono essere anche più grandi delle aziende farmaceutiche. Al contrario, i profitti delle società farmaceutiche, e quindi i loro prezzi azionari, tendono a fluttuare meno.
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